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RAP

實驗意義

探究轉錄后水平RNA與蛋白質的相互作用,以及轉錄后調控網絡的動態變化,可了解惡性腫瘤以及遺傳學疾病等轉錄后調控網絡的動態變化,應用于病理診斷和科學研究工作等。


實驗原理及流程

RNA反義純化(RNA Antisense Purification, RAP)設計一段與目標RNA互補的寡核苷酸探針,并對其進行生物素標記,使用該探針將目標RNA拉下來,同時與目標RNA相互作用的蛋白也被捕獲,然后經鏈霉親和素標記的磁珠純化,通過Real Time RT-PCR、WB、二代測序或質譜進行進一步的鑒定。實驗流程為探針設計→待測樣品準備(細胞、組織或待測RNA和蛋白質等)→生物素標記探針與RNA雜交→RAP→分離RNA和蛋白質進行鑒定分析。


結果展示[1]

rap1.png

 

實驗周期及交付標準

1. 實驗周期:1-3個月

2. 交付標準:RAP鑒定結果報告、分析報告、實驗報告(試劑、耗材、實驗步驟)、原始數據等

 

需確認的信息

1. 目的基因及種屬以及ID號。

2. 目的基因序列

3. 樣本數量及分析要求

 

參考文獻

[1] Engreitz J , Sirokman K , Mcdonel P , et al. RNA-RNA Interactions Enable Specific Targeting of Noncoding RNAs to Nascent Pre-mRNAs and Chromatin Sites[J]. Cell, 2014, 159(1):188-199.

[2] Engreitz J , Lander E S , Guttman M . RNA Antisense Purification (RAP) for Mapping RNA Interactions with Chromatin[J]. Methods Mol Biol, 2015, 1262(1262):183-197.


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