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RIP

胞內RNA與蛋白質結合情況的驗證:RIP


實驗意義

研究細胞內RNA與蛋白質的結合情況,有助于了解轉錄后調控網絡的動態過程,發現miRNA的調控靶點,可了解惡性腫瘤以及遺傳學疾病等整體水平的RNA變化以及轉錄后調控網絡的變化,應用于病理診斷及科學研究。


實驗原理及步驟

RNA結合蛋白免疫沉淀(RNA Binding Protein Immunoprecipitation, RIP)的基本原理是使用目標蛋白的抗體捕獲內源性的RNA-蛋白的復合物,然后通過免疫沉淀的方法把RNA-蛋白復合物一起分離下來,然后通過RT-PCR、RIP-Seq(高通量測序)或RIP-Chip(microarray)來鑒定結合的RNA序列。RIP流程如下圖[1]


結果展示

RIP1.png


RIP2.png


實驗周期及交付標準

1. 實驗周期:1-3個月

2. 交付標準:RIP鑒定結果報告、分析報告、實驗報告(試劑、耗材、實驗步驟)、原始數據等

 

需確認的信息

1. 目的基因與蛋白信息。

2. 是否提供抗體

3. 樣本分組及分析要求

 

參考文獻

[1] Gagliardi M, Matarazzo M R. RIP: RNA Immunoprecipitation[J]. Methods in Molecular Biology, 2016, 1480:73.

[2] Meyer K , K?Ster T , Nolte C , et al. Adaptation of iCLIP to plants determines the binding landscape of the clock-regulated RNA-binding protein AtGRP7[J]. Genome Biology, 2017, 18(1):204.

圖片1.png

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